Fuentes judiciales habían indicado que su detención se enmarcaba en la investigación sobre la transferencia de fondos procedentes del Partido Comunista de las Tierras Vascas y sobre un atentado cometido en junio de 2006 contra el complejo hotelero de la localidad vascofrancesa de Bidarray, del famoso cocinero francés Alain Ducasse.
Esas investigaciones, dirigidas por la juez antiterrorista francesa Laurence Le Vert, habían conducido al arresto el pasado 24 de septiembre de otros 14 miembros de Batasuna -que es legal en Francia-, todos ellos puestos en libertad sin cargos tres días más tarde.
Como no se encontraba en su domicilio, la policía no pudo detener entonces a Goieaskoetxea, que había sido citado para presentarse en Madrid el pasado 9 de septiembre por la Audiencia Nacional, pero no compareció.