1/09/2002: El jugador pasa control antidopaje al término del partido de la primera jornada de liga entre el Athletic Club y la Real Sociedad en Anoeta y da positivo por la presencia de mayor cantidad de la permitida del metabolito 19-norandrosterona.
10/12/2002: El Athletic anuncia que ha recibido una comunicación de la Real Federación Española de Fútbol (RFEF) en la que se indica que su jugador Carlos Gurpegui ha dado "valores de 19-norandrosterona superiores a los considerados fisiológicos en el control realizado el día 1 de septiembre de 2002".
13/12/2002: Cecilia Rodríguez, responsable del Laboratorio Antidopaje de Madrid, reconoce que esta instalación soportó una "excesiva carga de controles" en septiembre, lo que retrasó el análisis de la muestra del jugador del Athletic Gurpegui, si bien ello no supone "defecto de forma ni anulación del control".
31/12/2002: El jugador inicia una prueba de estimulación artificial para demostrar que su cuerpo produce 19-norandrosterona en situaciones de máximo esfuerzo. El estudio avalado por el Departamento de Química Analítica y Electroquímica de la Universidad de Extremadura (UEX) concluye el 6 de enero.
11/02/2003: El Comité de Competición en pleno, Sequeira, Vázquez y Zornoza, presenta su dimisión y denuncia «injerencias» en el 'caso Gurpegui'.
14/02/2003: El Comité de Competición de la Real Federación Española de Fútbol (RFEF), cuyos nuevos miembros (Alfredo Flórez, Lorenzo Pérez y Alberto Alonso) ejercieron por primera vez tras la dimisión de los anteriores integrantes, dicta una providencia por la que suspende cautelarmente la licencia de Gurpegi.
20/02/2003: El Comité de Apelación de la RFEF confirma "íntegramente" la decisión de Competición de suspender cautelarmente la licencia de Gurpegui hasta que se tramite el procedimiento abierto por dar positivo en un control.
27/02/2003: Sabino Padilla presenta el estudio que ha realizado la UEX a Gurpegui. En la conclusión se defiende que el jugador no ha tomado ninguna sustancia prohibida y que produce 19-norandrosterona de forma endógena. El club envía el informe a los distintos comités para tratar de que reconsideren la retirada cautelar de la licencia.
28/03/2003: El presidente del Athletic, Javier Uria, dimite como vocal de Junta Directiva de la RFEF al no tratar el Comité Español de Disciplina Deportiva (CEDD), en su fecha, el caso Gurpegui. Uria comunica al presidente de Ángel María Villar su sentimiento de "impotencia, indignación e indefensión".
4/04/2003: El CEDD deja sin efecto la suspensión cautelar de la licencia del futbolista. Esta decisión se produce tres días después de conocerse que el juez instructor del caso había pedido dos años de sanción para el jugador.
6/04/2003: Gurpegui vuelve a jugar con el Athletic en partido de liga contra el Atlético de Madrid 54 días después de la retirada cautelar de su ficha federativa.
6/05/2003: El Comité de Competición de la RFEF acuerda imponer a Gurpegui una sanción de dos años de suspensión de licencia federativa, vista la documentación relativa a los resultados del laboratorio de Control del Dopaje del Consejo Superior de Deportes (CSD).
19/05/2003: El Athletic recurre ante el Comité de Apelación el acuerdo de Competición de sancionar al jugador durante dos años, ya que defiende la tesis de que Gurpegui genera esa sustancia de forma endógena.
19/05/2003: La Asamblea de AFE decide tomar parte en la defensa de Gurpegui para ayudarle a demostrar su inocencia.
22/05/2003: El Comité de Apelación de la RFEF suspende cautelarmente la ejecución de la sanción de dos años impuesta al centrocampista.
12/06/2003: el Comité de Apelación ratificó la sanción pero, un día después, el CEDD concedió una nueva suspensión cautelar que le permitió jugar hasta el final de la Liga.
30/062003: El Athletic presenta ante la CEDD las alegaciones contra la sanción de dos años contra Gurpegui por presunto dopaje, dictada por el Comité de Competición de la Federación Española de Fútbol y ratificada por el de Apelación.
3/11/2003: El CEDD confirma la sanción de dos años por dopaje contra Gurpegui.
15/09/2004: La UEFA confirma que Gurpegi puede alinearse con "absoluta normalidad" en la Copa de la UEFA.
27/10/2004: El Comité de Apelación de la RFEF desestima el recurso presentado por el Athletic Club para que Gurpegui pueda disputar partidos amistosos.
26/11/2004: La Audiencia Nacional confirma la sanción de dos años por dopaje contra Gurpegui dictada por el Comité de Competición de la Real Federación Española de Fútbol y confirmada por el Comité de Apelación y por el Comité Español de Disciplina Deportiva.
19/01/2005: Ángel María Villar, presidente de la FEF, aseguró, tras reunirse hoy con el secretario de Estado para el Deporte, Jaime Lissavetzky, que otorgará sus ya anunciadas medidas de gracia "a principios de la próxima temporada".
28/04/2005: La RFEF retira la promesa de indulto que hizo su presidente Ángel María Villar.
31/07/2006: La Audiencia Nacional desestima el recurso que presentó Gurpegui contra la sanción que se le impuso por presunto dopaje y le confirma, por tanto, la suspensión de licencia federativa por dos años. La Sala de lo Contencioso-Administrativo de la Audiencia Nacional (Sección Tercera), órgano emisor de la sentencia, advierte, por su parte, de que "la sentencia es definitiva y no cabe contra la misma recurso ordinario de casación ante el Tribunal Supremo".
18/08/2006: El Athletic mantiene al jugador el dorsal (el 18) de Gurpegui como jugador de la primera plantilla, a pesar de la sanción.
13/09/2006: La RFEF informa al Athletic que Gurpegui no puede jugar partidos amistosos.
28/09/2006: El jugador interpone ante el Tribunal Constitucional una demanda de amparo en relación con la sentencia de la Audiencia Nacional.
24/01/2007: Gurpegui juega un partido que el Athletic denomina "de entrenamiento" contra el Valencia 'B' durante una concentración en Valencia del equipo bilbaíno.
24/02/2007: El Athletic y Gurpegui alcanzan un acuerdo para prorrogar el contrato del jugador por cuatro temporadas más, por lo que la vinculación entre ambas partes se alarga hasta el 30 de junio de 2012.
18/12/2007: Se conoce que el Tribunal Constitucional acuerda por unanimidad no admitir el recurso de amparo presentado por el jugador, que, por lo tanto, deberá cumplir íntegramente su sanción, cuyo plazo expira el próximo 23 de abril.
19/03/2008: Juega su primer partido 'de entrenamiento' fuera de Lezama desde el 24 de enero de 2007 en el campo de Basarte de Amurrio frente al equipo local.
16/04/2008: Gurpegui juega el último de los partidos de entrenamiento que ha disputado durante su sanción.
20/04/2008: El entrenador del Athletic Club, Joaquín Caparrós anuncia que el Gurpegui será titular en el primer partido que puede actuar tras su sanción, el del domingo 27 ante el Real Madrid en el Santiago Barnabéu.